Représentation de protéines par la sonification d’objets 3D
Auteur : Valère Raigneau
Directeur(s) de mémoire : Alan Blum & Tifanie Bouchara
Son
Résumé : Ce mémoire propose une entrée approfondie dans le domaine de la sonification de données, une jeune discipline dont le développement s’est particulièrement accru au cours des vingt dernières années. Notre travail de recherche s’inscrit spécifiquement au sein du projet VIDOCK, qui cherche à proposer aux biologistes plusieurs niveaux de représentation de protéines. À terme, l’objectif est de pouvoir identifier des similarités ou au contraire des singularités locales sur et entre différentes macromolécules. Le projet se consacre donc en particulier à la représentation visuelle de la surface des protéines en trois dimensions. Or, il a été montré que l’utilisation de la sonification permettait notamment de renforcer les représentations visuelles. Nous avons donc vu dans ce projet l’opportunité de mettre à profit les apports de la modalité auditive. Nous détaillons ainsi dans le présent manuscrit la conception et l’intégration de notre représentation sonore de protéines par la sonification d’objets 3D.
Mots-clés : Sonification de données, Interface sonore, Modalité auditive, Spatialisation, Visualisation, Protéine, Objet 3D, Surface, Forme.
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Abstract: This thesis proposes a deep insight into data sonification – a discipline that has gained significant interest over the last few years. Our work is conducted within the VIDOCK project which intends to propose to biologists several levels of displaying proteins. The long-term objective of this project is to identify local similarities or dissimilarities within and between various proteins. Accordingly, it focuses on visual representation of surface in three dimensions. However, it has been shown that having an auditory modality input would enhance visual display. It is why we see an opportunity in using sonification for this project. Therefore, we present in this manuscript the theoretical and practical conception of our own strategy of sonification of proteins as 3D objects.
Keywords: Sonification, Auditory display, Auditory modality, Spatialization, Visualization, Protein, 3D objet, Surface, Shape.
